Какой протокол будет использовать например. Для такого соединения настройки на tau-pci менять скорее всего не прийдется так как подойдут параметры по умолчанию. Синхронизация должна быть внешняя т.е. extclock (или тоже самое скорость 0).
Что и как делать в самой FreeBSD можно посмотреть например вот тут:
http://www.cronyx.ru/software/pdf/2freebsd.pdf