через вызовы read()/write(). Сигналы DTR, RTS и псевдосигнал LE появятся после вызова open() на соответствующее устройство. Для ext clock скорость задать нельзя. Скорости карта не знает в случае ext, но она ее "чувствует" по поступающиму синхросигналу.
Устройство к которому подключена плата воспринимает модемные сигналы? Если да, то скорее всего плата ничего не принемает потому как ей ничего и не передают из-за сигналов.
Для raw не важно какой hdlc пакет, будь то X.25 или PPP.