Если не затруднит, можете короткий пример действий прислать, и я тогда посмотрю в чем дело. Да и ссылку на тот материал в котором сказано что за проблема появилась в 4.7. Это поможет быстрее войти в курс дела и найти решение.
Да, кстати, эта проблема касается только сигмы, или обычные com порты тоже подглюкивают?
И еще один момент, то что делает /etc/rc.d/serial не может быть случайно решением проблемы?