Спасибо за ответ, отдельно спасибо debian-russian@lists.debian.org и Vladislav [адрес приводить не буду].
1. Пункт 1. - остался, т.е. неправильно сделан #include <net/if.h>. Надо #include <linux/if.h>. "Неправильно" - это в моём случае и в моих условиях. Не знаю где и как.
2. Устанавливалось всё просто замечательно - устанавливаем хеадеры от бинарника, делаем на них ссылку /usr/src/linux, и там уже есть необходимый .config. Далее - cd /root/clinux; make; make install

3. И всё-таки, по умолчанию модули 'пихаются' не на место. Для 2.4.х структура каталогов изменилась. Неправильно, но вполне работает. Ну и ладно, я перенёс, кто не хочет - может не переносить.

4. Но всё равно имеем:
install -m 555 cronyx.sh /etc/rc.d/init.d/cronyx
Install: cannot create ...
По одной простой причине - в Дебиане нет /etc/rc.d/init.d, а есть /etc/init.d

Если мой опыт оказался кому-то полезным - я очень рад :)